孙承宗的一声气愤的怒吼，竟把方从哲和韩爌堵的一句话都没有，两人愣愣的无言以对。
“哼！”方从哲气的哼了一声，此刻他不想见孙承宗，转身离开内阁，一边走一边气哼哼的说：“你干你的，我干我的，不管了！”
看着怒气冲冲离开的首辅方从哲，韩爌也极为不高兴的对孙承宗说：“孙阁老，咱们同朝为官，何必呢？说翻脸就翻脸！你是阁臣，也要为朝廷的官员们着想，别忘了，你也有致士的时候！”说完也拂袖离去。
此时内阁只留下孤单影只的孙承宗，他一脸茫然，不知如何是好，所有的人都知道他和皇帝的关系十分密切，几乎应与大臣们成了对立面了。
这是受两头气呀，以防是皇帝的圣旨不能违背，另一方是大臣们的极力反对，这样下去君臣之间的关系肯定紧张，说不定会出现嘉靖年间的“大礼仪之争”的状态。
孙承宗叹了口气，心道：皇上你血气方刚，正是锐意进取的时候，初登大宝不知历程之艰难，希望皇上能顶住这次的政治风波，千万不要向嘉靖爷和万历爷，被大臣们弄的心灰意冷数十年不上朝，否则大明中兴遥遥无期了。
不久，方从哲将皇帝圣旨“封驳”，不予执行，指使六部十三廊科给事中上奏，反对新法。
一场群臣与皇权的针锋相对悄然展开了。
明朝后期，官僚权力开始膨胀，内阁实际权力已超过以往任何的相权，皇帝虽有生杀予夺的大权，但国家行政权力几乎转移到了官僚体系中，让皇帝也感到自己不是万能的了，只能退居幕后做最终决策者。嘉靖的“大礼仪”、万历的“国本之争”，都是皇权与官僚集团的权力争夺。虽然皇帝可以把不听话的大臣们杀掉，但是明朝的官员似乎都不怕死，杀了一批又上来一批，最后连皇帝都杀怕了，不得不妥协。
看到内阁将圣旨“封驳”和六部十三廊科给事中的奏章，朱由校极其愤慨，大怒的将这些奏章统统扔到了地上，怒喊起来：“迂腐之极！朝中大臣怎能有这群无知之人！拿下！将这上奏之人统统拿下！”
程化祥还在下面一一捡起这些被皇帝扔在地上的奏章，忽听皇帝的怒吼，小心翼翼的劝道：“万岁爷，这些都是言官，拿不得。”
“怎么拿不得！着北镇抚司将其下诏狱！”
“万岁爷，我大明祖制，言官上奏不可犯其罪，否则会有损您明君的声誉。当年嘉靖爷杀了几个言官留下诟病，后人对被杀的言官是津津乐道，视为忠臣，万历爷接受这个教训，不敢对言官怎样，也只是避而远之，陛下要三思啊。”
朱由校恼怒未平，听了程化祥的话犹豫了起来，伏案稍息片刻后，原本绷紧的脸色宽松些，低沉道：“把这些奏折都烧了吧，就当没发生
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